Year 2017, Volume 21 , Issue 3, Pages 378 - 384 2017-06-01

Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models
Kesikli Regresyon Modellerinin Kullanımıyla Midye Parazit Sayılarındaki Sıfır Yoğunluğunun Açıklanması

Emel Çankaya [1] , Olcay Alpay [2] , Ahmet Özer [3]


In many ecological applications, the absences of species are inevitable due to either detection faults in samples or
uninhabitable conditions for their existence, resulting in high number of zero counts or abundance. Usual practice for
modelling such data is regression modelling of log(abundance+1) and it is well know that resulting model is
inadequate for prediction purposes. New discrete models accounting for zero abundances, namely zero-inflated
regression (ZIP and ZINB), Hurdle-Poisson (HP) and Hurdle-Negative Binomial (HNB) amongst others are widely
preferred to the classical regression models. Due to the fact that mussels are one of the economically most important
aquatic products of Turkey, the purpose of this study is therefore to examine the performances of these four models
in determination of the significant biotic and abiotic factors on the occurrences of Nematopsis legeri parasite
harming the existence of Mediterranean mussels (Mytilus galloprovincialis L.). The data collected from the three
coastal regions of Sinop city in Turkey showed more than 50% of parasite counts on the average are zero-valued and
model comparisons were based on information criterion. The results showed that the probability of the occurrence of
this parasite is here best formulated by ZINB or HNB models and influential factors of models were found to be
correspondent with ecological differences of the regions.
  

 Ekolojik çalışmaların çoğunda, ya örneklemlerdeki belirleme hataları ya da türlerin varlıkları için elverişsiz yaşam koşulları sebebiyle, türlerin yoklukları kaçınılmazdır ve bunun sonucu olarak çok fazla miktarda sıfır sayısı ya da bolluğu ortaya çıkar. Bu tipteki veriler için genellikle log(bolluk+1) regresyon modellemesi yapılır ve oluşturulan modelinin kestirim için yetersiz olduğu bilinen bir gerçektir. Sıfır sayılı bollukları içeren, aralarında sıfır ağırlıklı regresyon (ZIP ve ZINB), engelli-poisson (HP) ve engelli negatif binom (HNB) bulunan yeni kesikli modeller klasik regresyon modellerine göre daha çok tercih edilmektedir. Türkiye için ekonomik açıdan en önemli deniz ürünlerinden biri olması nedeniyle, bu çalışmada Akdeniz midyelerinin (Mytilus galloprovincialis L.) varoluşlarının tehditi Nematopsis legeri paraziti için önemli biyotik ve abiyotik faktörlerin belirlenmesinde bu dört modelin performanslarının kıyaslanması amaçlanmıştır. Türkiye’nin Sinop şehrinin üç kıyı bölgesinden toplanan parazitlerin sayılarının ortalamada %50’den fazlasının sıfır değerli olduğu görülmüş ve oluşturulan modellerin kıyaslaması bilgi kriterleri ile yapılmıştır. Sonuçlar bu parazitlerin oluşma olasılıklarını en iyi ZINB ve HNB modelleriyle ifade edildiğini göstermiştir ve modellerde etkili faktörlerin bölgelerin çevresel farklılıklarıyla ilişkili olduğu bulunmuştur.

  • H. Greene, "Organisms in nature as a central focus for biology," Trends in Ecology and Evolution, vol. 20, pp. 23-27, 2005.
  • R. O’Hara and J. Kotze, "Do not log-transform count data," Methods in Ecology and Evolution, vol. 1, pp. 118-122, 2010.
  • A. Agresti, Categorical Data Analysis, New York: John Wiley& Sons Inc., 2002.
  • J. Hilbe, Negative Binomial Regression 2nd Edition, UK: Cambridge University Press, 2001.
  • M. Chipeta, B. Ngwir, C. Simoonga and L. Kazembe, "Zero adjusted models with applications to analysing helminths count data," November 2014. [Online]. Available: http://bmcresnotes.biomedcentral.com/articles/10.1186/1756-0500-7-856.
  • W. Greene, "Accounting for Excess Zeros and Sample Selection in Poisson and Negative Binomial Regression Models," NYU Working Paper No. EC-94-10, 1994.
  • D. Lambert, "Zero-inflated Poisson regression with an application to defects in manufacturing," Technometrics,, vol. 34, pp. 1-14, 1992.
  • J. Prasad, Zero-Inflated Censored Regression Models: An Application with Episode of Care Data, USA: M.S. thesis, Dept. Statistics, Brigham Young University, 2009.
  • J. Cragg, "Some Statistical Models for Limited Dependent Variables with Application to the Demand for Durable Goods," Econometrica, vol. 39, pp. 829-844, 1971.
  • H. Williams and A. Jones, Parasitic worms of fish, London: Taylor & Francis, 1994.
Subjects Mathematics
Published Date Haziran 2017
Journal Section Research Articles
Authors

Author: Emel Çankaya

Author: Olcay Alpay

Author: Ahmet Özer

Dates

Application Date : November 2, 2016
Acceptance Date : January 16, 2017
Publication Date : June 1, 2017

Bibtex @research article { saufenbilder298981, journal = {Sakarya University Journal of Science}, issn = {1301-4048}, eissn = {2147-835X}, address = {}, publisher = {Sakarya University}, year = {2017}, volume = {21}, pages = {378 - 384}, doi = {10.16984/saufenbilder.298981}, title = {Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models}, key = {cite}, author = {Çankaya, Emel and Alpay, Olcay and Özer, Ahmet} }
APA Çankaya, E , Alpay, O , Özer, A . (2017). Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models. Sakarya University Journal of Science , 21 (3) , 378-384 . DOI: 10.16984/saufenbilder.298981
MLA Çankaya, E , Alpay, O , Özer, A . "Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models". Sakarya University Journal of Science 21 (2017 ): 378-384 <http://www.saujs.sakarya.edu.tr/en/issue/26996/298981>
Chicago Çankaya, E , Alpay, O , Özer, A . "Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models". Sakarya University Journal of Science 21 (2017 ): 378-384
RIS TY - JOUR T1 - Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models AU - Emel Çankaya , Olcay Alpay , Ahmet Özer Y1 - 2017 PY - 2017 N1 - doi: 10.16984/saufenbilder.298981 DO - 10.16984/saufenbilder.298981 T2 - Sakarya University Journal of Science JF - Journal JO - JOR SP - 378 EP - 384 VL - 21 IS - 3 SN - 1301-4048-2147-835X M3 - doi: 10.16984/saufenbilder.298981 UR - https://doi.org/10.16984/saufenbilder.298981 Y2 - 2017 ER -
EndNote %0 Sakarya Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models %A Emel Çankaya , Olcay Alpay , Ahmet Özer %T Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models %D 2017 %J Sakarya University Journal of Science %P 1301-4048-2147-835X %V 21 %N 3 %R doi: 10.16984/saufenbilder.298981 %U 10.16984/saufenbilder.298981
ISNAD Çankaya, Emel , Alpay, Olcay , Özer, Ahmet . "Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models". Sakarya University Journal of Science 21 / 3 (June 2017): 378-384 . https://doi.org/10.16984/saufenbilder.298981
AMA Çankaya E , Alpay O , Özer A . Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models. SAUJS. 2017; 21(3): 378-384.
Vancouver Çankaya E , Alpay O , Özer A . Accounting for Zero Inflation of Mussel Parasite Counts Using Discrete Regression Models. Sakarya University Journal of Science. 2017; 21(3): 384-378.